Początki protestantyzmu w Koźminku sięgają połowy XVI wieku. Ówczesny właściciel Koźminka, Jakub Ostroróg herbu Nałęcz, jeszcze w czasie studiów w Lipsku i Wittenberdze zetknął się z reformacją i jej przywódcami. Po przybyciu do Wielkopolski braci czeskich, przyjął ich wyznanie i został ich obrońcą i protektorem. Od tego czasu Koźminek stał się jednym z ważniejszych ośrodków innowierczych w Wielkopolsce.
Kaplica ewangelicko-augsburska została wybudowana w 1908 roku, z materiałów pochodzących z rozebranego spichlerza w Nakwasinie, który wcześniej służył jako zbór ariański. Kaplica była użytkowana z pierwotnym przeznaczeniem do lat 80. XX wieku.
